Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.86
ERCC6Q03468 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
ERCC6Q03468 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms