Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ROM1Q03395 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ROM1Q03395 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ROM1Q03395 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ROM1Q03395 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ROM1Q03395 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms