Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUCB1Q02818 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms