Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2BQ00403 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2BQ00403 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms