Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP5P82980 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP5P82980 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP5P82980 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP5P82980 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP5P82980 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP5P82980 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP5P82980 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP5P82980 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP5P82980 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP5P82980 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP5P82980 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP5P82980 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP5P82980 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP5P82980 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBP5P82980 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP5P82980 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP5P82980 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP5P82980 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP5P82980 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP5P82980 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP5P82980 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP5P82980 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP5P82980 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP5P82980 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP5P82980 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP5P82980 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP5P82980 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP5P82980 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBP5P82980 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBP5P82980 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBP5P82980 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBP5P82980 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBP5P82980 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBP5P82980 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBP5P82980 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RBP5P82980 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RBP5P82980 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RBP5P82980 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RBP5P82980 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RBP5P82980 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBP5P82980 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBP5P82980 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBP5P82980 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBP5P82980 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBP5P82980 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBP5P82980 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RBP5P82980 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBP5P82980 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBP5P82980 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBP5P82980 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBP5P82980 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RBP5P82980 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBP5P82980 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBP5P82980 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP5P82980 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP5P82980 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP5P82980 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP5P82980 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP5P82980 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP5P82980 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP5P82980 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP5P82980 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP5P82980 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP5P82980 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBP5P82980 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
RBP5P82980 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBP5P82980 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBP5P82980 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBP5P82980 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBP5P82980 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBP5P82980 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBP5P82980 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBP5P82980 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBP5P82980 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RBP5P82980 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RBP5P82980 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBP5P82980 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBP5P82980 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBP5P82980 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RBP5P82980 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBP5P82980 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP5P82980 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP5P82980 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP5P82980 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP5P82980 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP5P82980 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP5P82980 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP5P82980 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP5P82980 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP5P82980 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP5P82980 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP5P82980 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RBP5P82980 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP5P82980 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP5P82980 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP5P82980 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP5P82980 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP5P82980 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP5P82980 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms