Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSNL1P62760 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VSNL1P62760 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms