Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPEP62304 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms