Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVK-21P61565 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ERVK-21P61565 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-21P61565 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-21P61565 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-21P61565 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-21P61565 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-21P61565 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-21P61565 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-21P61565 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-21P61565 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-21P61565 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-21P61565 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVK-21P61565 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms