Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCR4P61073 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCR4P61073 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms