Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFRD-1P60508 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVFRD-1P60508 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms