Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms