Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC00310P59036 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00310P59036 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms