Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARL4CP56559 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4CP56559 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms