Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA1P56199 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA1P56199 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms