Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH11P55287 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH11P55287 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH11P55287 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH11P55287 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH11P55287 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH11P55287 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH11P55287 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH11P55287 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH11P55287 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH11P55287 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH11P55287 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH11P55287 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH11P55287 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH11P55287 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH11P55287 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH11P55287 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH11P55287 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH11P55287 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH11P55287 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH11P55287 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH11P55287 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH11P55287 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH11P55287 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH11P55287 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH11P55287 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH11P55287 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH11P55287 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH11P55287 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH11P55287 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH11P55287 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH11P55287 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH11P55287 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH11P55287 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH11P55287 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH11P55287 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH11P55287 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH11P55287 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH11P55287 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDH11P55287 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDH11P55287 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDH11P55287 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH11P55287 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH11P55287 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH11P55287 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH11P55287 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH11P55287 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH11P55287 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH11P55287 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH11P55287 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH11P55287 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH11P55287 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH11P55287 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH11P55287 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH11P55287 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH11P55287 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH11P55287 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH11P55287 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH11P55287 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH11P55287 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH11P55287 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH11P55287 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH11P55287 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH11P55287 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH11P55287 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH11P55287 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH11P55287 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH11P55287 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH11P55287 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH11P55287 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH11P55287 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH11P55287 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH11P55287 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH11P55287 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH11P55287 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH11P55287 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH11P55287 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH11P55287 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH11P55287 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH11P55287 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH11P55287 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH11P55287 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH11P55287 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH11P55287 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH11P55287 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH11P55287 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH11P55287 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH11P55287 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH11P55287 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH11P55287 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH11P55287 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH11P55287 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH11P55287 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH11P55287 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH11P55287 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH11P55287 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH11P55287 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH11P55287 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH11P55287 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH11P55287 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms