Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCKAP1LP55160 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms