Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MANFP55145 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MANFP55145 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MANFP55145 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MANFP55145 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MANFP55145 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MANFP55145 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MANFP55145 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MANFP55145 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MANFP55145 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MANFP55145 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MANFP55145 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MANFP55145 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MANFP55145 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MANFP55145 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MANFP55145 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MANFP55145 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MANFP55145 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MANFP55145 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MANFP55145 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MANFP55145 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MANFP55145 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MANFP55145 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MANFP55145 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MANFP55145 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MANFP55145 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MANFP55145 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MANFP55145 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MANFP55145 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MANFP55145 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MANFP55145 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MANFP55145 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MANFP55145 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MANFP55145 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MANFP55145 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MANFP55145 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MANFP55145 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MANFP55145 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MANFP55145 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MANFP55145 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MANFP55145 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MANFP55145 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MANFP55145 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MANFP55145 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MANFP55145 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MANFP55145 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MANFP55145 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MANFP55145 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MANFP55145 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MANFP55145 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MANFP55145 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MANFP55145 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MANFP55145 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MANFP55145 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MANFP55145 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MANFP55145 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MANFP55145 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MANFP55145 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MANFP55145 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MANFP55145 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MANFP55145 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MANFP55145 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MANFP55145 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MANFP55145 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MANFP55145 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MANFP55145 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MANFP55145 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MANFP55145 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MANFP55145 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MANFP55145 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MANFP55145 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MANFP55145 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MANFP55145 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MANFP55145 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MANFP55145 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MANFP55145 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MANFP55145 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MANFP55145 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MANFP55145 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MANFP55145 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MANFP55145 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MANFP55145 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MANFP55145 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MANFP55145 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MANFP55145 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MANFP55145 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MANFP55145 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MANFP55145 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MANFP55145 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MANFP55145 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MANFP55145 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MANFP55145 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MANFP55145 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MANFP55145 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MANFP55145 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MANFP55145 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MANFP55145 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MANFP55145 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MANFP55145 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MANFP55145 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms