Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAPOLAP51003 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms