Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX5P50542 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX5P50542 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX5P50542 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX5P50542 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX5P50542 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX5P50542 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX5P50542 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX5P50542 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX5P50542 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX5P50542 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX5P50542 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX5P50542 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX5P50542 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX5P50542 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX5P50542 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX5P50542 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX5P50542 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX5P50542 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX5P50542 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX5P50542 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX5P50542 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX5P50542 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX5P50542 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX5P50542 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX5P50542 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX5P50542 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX5P50542 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX5P50542 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX5P50542 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX5P50542 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX5P50542 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX5P50542 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX5P50542 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX5P50542 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX5P50542 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX5P50542 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX5P50542 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX5P50542 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX5P50542 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX5P50542 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX5P50542 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX5P50542 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX5P50542 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX5P50542 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX5P50542 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX5P50542 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX5P50542 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX5P50542 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX5P50542 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX5P50542 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX5P50542 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX5P50542 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX5P50542 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX5P50542 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX5P50542 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX5P50542 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX5P50542 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX5P50542 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX5P50542 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX5P50542 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX5P50542 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX5P50542 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX5P50542 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX5P50542 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX5P50542 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX5P50542 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX5P50542 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX5P50542 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX5P50542 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX5P50542 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX5P50542 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX5P50542 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX5P50542 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX5P50542 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX5P50542 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX5P50542 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX5P50542 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX5P50542 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PEX5P50542 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PEX5P50542 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PEX5P50542 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PEX5P50542 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PEX5P50542 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PEX5P50542 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX5P50542 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX5P50542 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX5P50542 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX5P50542 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX5P50542 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX5P50542 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX5P50542 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX5P50542 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX5P50542 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX5P50542 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX5P50542 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX5P50542 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX5P50542 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX5P50542 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX5P50542 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms