Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARRES1P49788 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms