Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSEN1P49768 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSEN1P49768 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms