Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ALDH9A1P49189 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALDH9A1P49189 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALDH9A1P49189 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms