Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms