Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RXRGP48443 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RXRGP48443 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RXRGP48443 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RXRGP48443 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RXRGP48443 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RXRGP48443 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RXRGP48443 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RXRGP48443 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RXRGP48443 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RXRGP48443 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RXRGP48443 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RXRGP48443 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RXRGP48443 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RXRGP48443 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RXRGP48443 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RXRGP48443 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RXRGP48443 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RXRGP48443 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RXRGP48443 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RXRGP48443 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RXRGP48443 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RXRGP48443 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RXRGP48443 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RXRGP48443 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RXRGP48443 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RXRGP48443 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RXRGP48443 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RXRGP48443 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RXRGP48443 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RXRGP48443 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RXRGP48443 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RXRGP48443 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RXRGP48443 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RXRGP48443 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RXRGP48443 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RXRGP48443 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RXRGP48443 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RXRGP48443 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RXRGP48443 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RXRGP48443 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RXRGP48443 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RXRGP48443 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RXRGP48443 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RXRGP48443 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RXRGP48443 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RXRGP48443 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RXRGP48443 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RXRGP48443 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RXRGP48443 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RXRGP48443 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RXRGP48443 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RXRGP48443 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RXRGP48443 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RXRGP48443 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RXRGP48443 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RXRGP48443 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RXRGP48443 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RXRGP48443 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RXRGP48443 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RXRGP48443 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RXRGP48443 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RXRGP48443 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RXRGP48443 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RXRGP48443 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RXRGP48443 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RXRGP48443 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RXRGP48443 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RXRGP48443 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RXRGP48443 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RXRGP48443 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RXRGP48443 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RXRGP48443 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RXRGP48443 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RXRGP48443 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RXRGP48443 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RXRGP48443 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RXRGP48443 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RXRGP48443 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RXRGP48443 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RXRGP48443 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RXRGP48443 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RXRGP48443 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RXRGP48443 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RXRGP48443 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RXRGP48443 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RXRGP48443 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RXRGP48443 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RXRGP48443 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RXRGP48443 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RXRGP48443 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RXRGP48443 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RXRGP48443 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RXRGP48443 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RXRGP48443 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RXRGP48443 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RXRGP48443 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RXRGP48443 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RXRGP48443 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RXRGP48443 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms