Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALDH1A3P47895 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms