Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XCR1P46094 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XCR1P46094 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
XCR1P46094 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XCR1P46094 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XCR1P46094 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XCR1P46094 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XCR1P46094 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XCR1P46094 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XCR1P46094 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XCR1P46094 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XCR1P46094 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XCR1P46094 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XCR1P46094 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XCR1P46094 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XCR1P46094 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XCR1P46094 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XCR1P46094 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
XCR1P46094 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XCR1P46094 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XCR1P46094 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XCR1P46094 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
XCR1P46094 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XCR1P46094 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XCR1P46094 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XCR1P46094 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XCR1P46094 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XCR1P46094 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XCR1P46094 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XCR1P46094 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XCR1P46094 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
XCR1P46094 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
XCR1P46094 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XCR1P46094 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XCR1P46094 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XCR1P46094 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XCR1P46094 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XCR1P46094 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XCR1P46094 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XCR1P46094 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XCR1P46094 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XCR1P46094 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XCR1P46094 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XCR1P46094 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XCR1P46094 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XCR1P46094 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XCR1P46094 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XCR1P46094 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XCR1P46094 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XCR1P46094 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XCR1P46094 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
XCR1P46094 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XCR1P46094 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XCR1P46094 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XCR1P46094 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XCR1P46094 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XCR1P46094 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XCR1P46094 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XCR1P46094 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XCR1P46094 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XCR1P46094 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
XCR1P46094 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XCR1P46094 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XCR1P46094 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
XCR1P46094 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.3■■□□□ 1
XCR1P46094 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
XCR1P46094 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XCR1P46094 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XCR1P46094 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
XCR1P46094 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XCR1P46094 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
XCR1P46094 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
XCR1P46094 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XCR1P46094 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XCR1P46094 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XCR1P46094 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
XCR1P46094 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
XCR1P46094 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
XCR1P46094 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XCR1P46094 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XCR1P46094 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XCR1P46094 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XCR1P46094 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XCR1P46094 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
XCR1P46094 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XCR1P46094 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XCR1P46094 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
XCR1P46094 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.28■■□□□ 1
XCR1P46094 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XCR1P46094 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XCR1P46094 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XCR1P46094 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
XCR1P46094 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XCR1P46094 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XCR1P46094 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XCR1P46094 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
XCR1P46094 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XCR1P46094 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
XCR1P46094 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XCR1P46094 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms