Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RANGAP1P46060 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
RANGAP1P46060 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RANGAP1P46060 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms