Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms