Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF9P41273 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF9P41273 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms