Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VHLP40337 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VHLP40337 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VHLP40337 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VHLP40337 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VHLP40337 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VHLP40337 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VHLP40337 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VHLP40337 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VHLP40337 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VHLP40337 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VHLP40337 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VHLP40337 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VHLP40337 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VHLP40337 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VHLP40337 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VHLP40337 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VHLP40337 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VHLP40337 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VHLP40337 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VHLP40337 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VHLP40337 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VHLP40337 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VHLP40337 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VHLP40337 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VHLP40337 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VHLP40337 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VHLP40337 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VHLP40337 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VHLP40337 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VHLP40337 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VHLP40337 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VHLP40337 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VHLP40337 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VHLP40337 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VHLP40337 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VHLP40337 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VHLP40337 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VHLP40337 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VHLP40337 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VHLP40337 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VHLP40337 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VHLP40337 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VHLP40337 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VHLP40337 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VHLP40337 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VHLP40337 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLP40337 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLP40337 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLP40337 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLP40337 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLP40337 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLP40337 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLP40337 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLP40337 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLP40337 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLP40337 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLP40337 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLP40337 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLP40337 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLP40337 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLP40337 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VHLP40337 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VHLP40337 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VHLP40337 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VHLP40337 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VHLP40337 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VHLP40337 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VHLP40337 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VHLP40337 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VHLP40337 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VHLP40337 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VHLP40337 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VHLP40337 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VHLP40337 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VHLP40337 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VHLP40337 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VHLP40337 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VHLP40337 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VHLP40337 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VHLP40337 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VHLP40337 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VHLP40337 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VHLP40337 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VHLP40337 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VHLP40337 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VHLP40337 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VHLP40337 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VHLP40337 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VHLP40337 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VHLP40337 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VHLP40337 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VHLP40337 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VHLP40337 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
VHLP40337 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VHLP40337 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VHLP40337 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VHLP40337 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VHLP40337 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VHLP40337 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms