Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FEN1P39748 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FEN1P39748 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FEN1P39748 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FEN1P39748 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FEN1P39748 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FEN1P39748 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FEN1P39748 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FEN1P39748 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FEN1P39748 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FEN1P39748 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FEN1P39748 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FEN1P39748 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FEN1P39748 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FEN1P39748 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FEN1P39748 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FEN1P39748 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FEN1P39748 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FEN1P39748 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FEN1P39748 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FEN1P39748 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FEN1P39748 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FEN1P39748 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FEN1P39748 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FEN1P39748 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FEN1P39748 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FEN1P39748 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FEN1P39748 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FEN1P39748 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FEN1P39748 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FEN1P39748 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FEN1P39748 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FEN1P39748 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FEN1P39748 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FEN1P39748 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FEN1P39748 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FEN1P39748 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FEN1P39748 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FEN1P39748 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FEN1P39748 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FEN1P39748 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FEN1P39748 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FEN1P39748 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FEN1P39748 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FEN1P39748 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FEN1P39748 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FEN1P39748 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FEN1P39748 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FEN1P39748 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FEN1P39748 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FEN1P39748 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FEN1P39748 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FEN1P39748 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FEN1P39748 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FEN1P39748 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FEN1P39748 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FEN1P39748 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FEN1P39748 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FEN1P39748 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FEN1P39748 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FEN1P39748 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FEN1P39748 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FEN1P39748 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FEN1P39748 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FEN1P39748 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FEN1P39748 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FEN1P39748 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FEN1P39748 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FEN1P39748 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FEN1P39748 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FEN1P39748 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FEN1P39748 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FEN1P39748 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FEN1P39748 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FEN1P39748 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FEN1P39748 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FEN1P39748 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FEN1P39748 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FEN1P39748 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FEN1P39748 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FEN1P39748 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FEN1P39748 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FEN1P39748 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FEN1P39748 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FEN1P39748 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FEN1P39748 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FEN1P39748 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FEN1P39748 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FEN1P39748 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FEN1P39748 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FEN1P39748 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FEN1P39748 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FEN1P39748 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FEN1P39748 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FEN1P39748 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FEN1P39748 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FEN1P39748 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FEN1P39748 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FEN1P39748 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FEN1P39748 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms