Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms