Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX5P35711 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX5P35711 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX5P35711 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX5P35711 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX5P35711 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX5P35711 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX5P35711 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX5P35711 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX5P35711 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX5P35711 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX5P35711 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX5P35711 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX5P35711 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX5P35711 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX5P35711 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX5P35711 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX5P35711 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX5P35711 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX5P35711 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX5P35711 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX5P35711 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX5P35711 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX5P35711 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX5P35711 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX5P35711 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX5P35711 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX5P35711 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX5P35711 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX5P35711 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX5P35711 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX5P35711 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX5P35711 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX5P35711 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX5P35711 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX5P35711 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX5P35711 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX5P35711 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX5P35711 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX5P35711 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX5P35711 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX5P35711 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX5P35711 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX5P35711 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX5P35711 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX5P35711 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX5P35711 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX5P35711 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX5P35711 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX5P35711 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX5P35711 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX5P35711 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX5P35711 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX5P35711 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOX5P35711 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SOX5P35711 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SOX5P35711 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SOX5P35711 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SOX5P35711 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX5P35711 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX5P35711 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX5P35711 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX5P35711 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX5P35711 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX5P35711 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX5P35711 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX5P35711 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX5P35711 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX5P35711 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX5P35711 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX5P35711 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX5P35711 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX5P35711 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX5P35711 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX5P35711 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX5P35711 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX5P35711 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX5P35711 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX5P35711 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX5P35711 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX5P35711 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX5P35711 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX5P35711 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX5P35711 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX5P35711 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX5P35711 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX5P35711 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX5P35711 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX5P35711 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX5P35711 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX5P35711 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX5P35711 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX5P35711 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX5P35711 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX5P35711 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX5P35711 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX5P35711 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX5P35711 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX5P35711 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX5P35711 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms