Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HNF1BP35680 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HNF1BP35680 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms