Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR1P32246 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR1P32246 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR1P32246 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR1P32246 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR1P32246 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR1P32246 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR1P32246 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR1P32246 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR1P32246 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR1P32246 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR1P32246 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR1P32246 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR1P32246 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR1P32246 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR1P32246 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR1P32246 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR1P32246 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR1P32246 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR1P32246 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR1P32246 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR1P32246 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR1P32246 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR1P32246 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR1P32246 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR1P32246 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR1P32246 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR1P32246 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR1P32246 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR1P32246 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR1P32246 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR1P32246 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR1P32246 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR1P32246 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR1P32246 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR1P32246 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR1P32246 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR1P32246 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR1P32246 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR1P32246 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR1P32246 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR1P32246 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR1P32246 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR1P32246 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR1P32246 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR1P32246 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR1P32246 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR1P32246 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR1P32246 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR1P32246 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR1P32246 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR1P32246 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR1P32246 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR1P32246 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR1P32246 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR1P32246 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR1P32246 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR1P32246 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR1P32246 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR1P32246 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR1P32246 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR1P32246 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR1P32246 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR1P32246 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR1P32246 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR1P32246 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR1P32246 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR1P32246 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR1P32246 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR1P32246 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR1P32246 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR1P32246 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR1P32246 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR1P32246 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR1P32246 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR1P32246 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR1P32246 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR1P32246 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR1P32246 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR1P32246 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR1P32246 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR1P32246 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR1P32246 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR1P32246 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR1P32246 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR1P32246 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR1P32246 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR1P32246 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR1P32246 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR1P32246 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR1P32246 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR1P32246 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR1P32246 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR1P32246 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR1P32246 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR1P32246 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR1P32246 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR1P32246 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR1P32246 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCR1P32246 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms