Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OTX2P32243 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTX2P32243 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTX2P32243 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTX2P32243 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTX2P32243 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTX2P32243 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTX2P32243 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTX2P32243 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTX2P32243 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTX2P32243 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTX2P32243 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTX2P32243 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTX2P32243 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTX2P32243 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTX2P32243 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTX2P32243 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTX2P32243 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
OTX2P32243 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTX2P32243 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
OTX2P32243 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTX2P32243 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTX2P32243 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTX2P32243 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTX2P32243 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTX2P32243 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTX2P32243 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTX2P32243 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTX2P32243 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTX2P32243 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTX2P32243 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTX2P32243 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTX2P32243 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTX2P32243 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTX2P32243 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTX2P32243 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTX2P32243 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTX2P32243 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTX2P32243 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
OTX2P32243 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
OTX2P32243 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
OTX2P32243 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
OTX2P32243 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
OTX2P32243 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OTX2P32243 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OTX2P32243 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OTX2P32243 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OTX2P32243 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OTX2P32243 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OTX2P32243 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OTX2P32243 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OTX2P32243 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTX2P32243 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTX2P32243 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTX2P32243 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTX2P32243 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTX2P32243 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTX2P32243 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTX2P32243 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTX2P32243 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTX2P32243 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTX2P32243 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTX2P32243 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTX2P32243 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTX2P32243 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTX2P32243 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTX2P32243 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTX2P32243 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTX2P32243 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTX2P32243 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTX2P32243 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTX2P32243 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTX2P32243 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTX2P32243 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTX2P32243 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTX2P32243 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTX2P32243 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTX2P32243 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTX2P32243 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms