Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC13P31276 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms