Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms