Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC27P30260 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC27P30260 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC27P30260 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC27P30260 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC27P30260 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC27P30260 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC27P30260 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC27P30260 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC27P30260 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC27P30260 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC27P30260 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC27P30260 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC27P30260 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC27P30260 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC27P30260 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC27P30260 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC27P30260 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC27P30260 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC27P30260 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC27P30260 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC27P30260 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC27P30260 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC27P30260 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC27P30260 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC27P30260 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC27P30260 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC27P30260 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC27P30260 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC27P30260 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC27P30260 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC27P30260 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC27P30260 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC27P30260 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC27P30260 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC27P30260 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC27P30260 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC27P30260 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC27P30260 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC27P30260 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC27P30260 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC27P30260 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC27P30260 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC27P30260 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC27P30260 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC27P30260 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC27P30260 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC27P30260 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC27P30260 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC27P30260 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC27P30260 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC27P30260 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC27P30260 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC27P30260 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC27P30260 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC27P30260 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC27P30260 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC27P30260 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC27P30260 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC27P30260 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC27P30260 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC27P30260 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC27P30260 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC27P30260 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC27P30260 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC27P30260 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC27P30260 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC27P30260 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC27P30260 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC27P30260 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC27P30260 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC27P30260 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC27P30260 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC27P30260 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC27P30260 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC27P30260 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC27P30260 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC27P30260 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC27P30260 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC27P30260 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC27P30260 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC27P30260 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC27P30260 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC27P30260 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC27P30260 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC27P30260 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC27P30260 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC27P30260 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC27P30260 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC27P30260 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC27P30260 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC27P30260 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC27P30260 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC27P30260 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC27P30260 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC27P30260 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC27P30260 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC27P30260 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC27P30260 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC27P30260 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms