Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTR1EP28566 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms