Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms