Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB9P28065 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms