Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPA1P27694 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPA1P27694 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPA1P27694 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPA1P27694 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPA1P27694 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPA1P27694 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPA1P27694 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPA1P27694 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RPA1P27694 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPA1P27694 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPA1P27694 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPA1P27694 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPA1P27694 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPA1P27694 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPA1P27694 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPA1P27694 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPA1P27694 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RPA1P27694 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPA1P27694 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPA1P27694 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPA1P27694 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPA1P27694 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPA1P27694 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPA1P27694 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPA1P27694 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPA1P27694 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPA1P27694 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPA1P27694 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPA1P27694 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPA1P27694 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPA1P27694 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPA1P27694 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPA1P27694 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPA1P27694 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RPA1P27694 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPA1P27694 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPA1P27694 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPA1P27694 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPA1P27694 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPA1P27694 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPA1P27694 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPA1P27694 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPA1P27694 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPA1P27694 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPA1P27694 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPA1P27694 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPA1P27694 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA1P27694 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA1P27694 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA1P27694 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA1P27694 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA1P27694 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA1P27694 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA1P27694 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA1P27694 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA1P27694 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA1P27694 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA1P27694 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA1P27694 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA1P27694 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA1P27694 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA1P27694 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA1P27694 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA1P27694 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA1P27694 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA1P27694 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPA1P27694 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPA1P27694 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPA1P27694 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPA1P27694 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RPA1P27694 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPA1P27694 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RPA1P27694 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPA1P27694 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPA1P27694 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPA1P27694 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPA1P27694 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPA1P27694 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPA1P27694 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPA1P27694 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPA1P27694 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPA1P27694 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPA1P27694 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPA1P27694 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPA1P27694 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPA1P27694 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPA1P27694 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPA1P27694 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPA1P27694 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPA1P27694 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPA1P27694 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPA1P27694 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPA1P27694 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPA1P27694 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPA1P27694 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPA1P27694 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPA1P27694 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPA1P27694 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPA1P27694 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms