Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTFRP26992 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms