Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms