Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA3P26006 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA3P26006 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms