Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMA3P25788 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms