Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCM3P25205 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCM3P25205 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCM3P25205 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCM3P25205 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM3P25205 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM3P25205 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM3P25205 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM3P25205 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM3P25205 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM3P25205 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM3P25205 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM3P25205 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM3P25205 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCM3P25205 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM3P25205 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM3P25205 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM3P25205 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM3P25205 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM3P25205 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM3P25205 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM3P25205 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM3P25205 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM3P25205 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM3P25205 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM3P25205 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM3P25205 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM3P25205 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM3P25205 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM3P25205 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM3P25205 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM3P25205 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCM3P25205 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM3P25205 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM3P25205 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM3P25205 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM3P25205 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM3P25205 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM3P25205 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM3P25205 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM3P25205 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM3P25205 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCM3P25205 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM3P25205 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM3P25205 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM3P25205 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM3P25205 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM3P25205 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM3P25205 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM3P25205 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM3P25205 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM3P25205 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM3P25205 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM3P25205 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM3P25205 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM3P25205 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM3P25205 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM3P25205 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM3P25205 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3P25205 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3P25205 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3P25205 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3P25205 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3P25205 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3P25205 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3P25205 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3P25205 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3P25205 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3P25205 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3P25205 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3P25205 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3P25205 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3P25205 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3P25205 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3P25205 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3P25205 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3P25205 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3P25205 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3P25205 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3P25205 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3P25205 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3P25205 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3P25205 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3P25205 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3P25205 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3P25205 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3P25205 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3P25205 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3P25205 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3P25205 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3P25205 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3P25205 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3P25205 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3P25205 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3P25205 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3P25205 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3P25205 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3P25205 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3P25205 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3P25205 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms