Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDELR1P24390 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms