Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB6AP20340 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB6AP20340 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms